例の「日中歴史共同研究」の報告書が発表され、オンラインでも読むことができるようになっています。
http://www.mofa.go.jp/mofaj/area/china/rekishi_kk.html
南京事件に関する記述を含む章の担当者は波多野澄雄・庄司潤一郎の両氏です。脚注で中島今朝吾・第16師団長（当時）が「中村今朝吾」になっちゃってる箇所がありました。
内容については、また改めて。
ちなみに張作霖爆殺事件については、日本側の報告書（当該箇所の執筆者は服部龍二氏）はもちろん「関東軍の謀略」としてました。
cf. http://sankei.jp.msn.com/politics/situation/100131/stt1001310946001-n1.htm
